Действие Soul Reaver 2 происходит в Носготе, вымышленной стране с элементами фэнтези. В первой игре серии, Blood Omen: Legacy of Kain, вампир Каин отправляется в путешествие, чтобы восстановить Столпы Носгота - девять сверхъестественных построек, которые неразрывно связаны со здоровьем земли, но становятся поврежденными. Во время своего приключения Мебиус, колдун-манипулятор, обманом заставляет Каина организовать уничтожение расы вампиров: Каин остается последним выжившим вампиром в Носготе. Восстановив восемь из столпов, Каин обнаруживает, что ему нужно пожертвовать собственной жизнью, чтобы восстановить последний испорченный. Понимая, что его смерть обеспечит уничтожение его вида, он отказывается убивать себя. Это вызывает коллапс Столпов и обрекает мир на вечный распад, но позволяет Каину продолжать жить и возродить расу вампиров.
К моменту создания Soul Reaver, 1500 лет спустя, Каин стал деспотическим императором, его вампиры правят землей, а Носгот оказался на грани краха. Старший Бог, сущность, похожая на демиурга, скрывается под Носготом и контролирует цикл реинкарнации; вампиры, биологическое бессмертие которых противоречит его доктрине, являются его врагами. В Soul Reaver Разиэль - лейтенант Каина - казнен Каином, но Старший Бог воскрешает его и побуждает отомстить. Путешествуя по пустоши и убивая вампиров, Разиэль противостоит Каину, который атакует его мечом Похитителя душ, наполненного духом, который поглощает души своих жертв. Похититель душ разрушается, когда ударяет Разиэля, и дух клинка связывается с его рукой. Его мотивы все еще остаются загадочными, Каин заманивает Разиэля через портал времени в прошлое Носгота.
В Soul Reaver 2 установлено, что в Носготе фатализм - это реальность - история неизменна, и все люди подвержены предопределению. Разиэль, из-за его парадоксальной судьбы, является единственным исключением из этого правила - его присутствие позволяет запускать временные парадоксы, изменяя историю к лучшему или худшему. Каин полагается на свободную волю Разиэля, пытаясь перехитрить Мебиуса и разрешить дилемму, с которой он столкнулся в Blood Omen, в конечном итоге надеясь, что восстановленные Столпы и раса вампиров смогут сосуществовать в будущем. Soul Reaver 2 открывается, когда Разиэль выходит из временного промежутка и приветствуется Мобиусом, прибывшим в эпоху за 30 лет до событий Blood Omen. Еще два периода времени, 100 лет после и 500 лет до Blood Omen соответственно, также исследуются по мере развития сюжета.